光绪二十八年（1902年）正月初一，皇帝前往太庙举行祭祀仪式，缅怀先祖，祈求国家安宁。正月初二，向上帝祈求五谷丰登，表达对农业生产的重视。正月初四，四川提督宋庆去世，朝廷追晋他为三等男爵，以表彰其功绩。正月初八，朝廷任命张翼全面负责路矿事宜，王文韶、瞿鸿禨担任督理，监督工作进展；同时，让吕海寰与盛宣怀共同商议商约，试图在经济领域与列强周旋。正月初九，朝廷裁撤河东河道总督一职，对河道管理体制进行调整。此外，还命令各省官员清查屯地，将屯饷改为丁粮，撤销卫所官员，将其职能归并到军营，同时裁撤屯丁和运军，这一系列举措旨在优化地方管理，提高行政效率。同一天，朝廷谕令各省设立农工学堂，希望借此推动农业和工业的发展，培养相关人才。正月十九，詹事府、通政使司被裁撤，进一步精简行政机构。
二月初一，朝廷任命张德彝为出使西班牙专使，前往西班牙祝贺其君主加冕，以维护邦交。二月初二，朝廷谕令各省迅速设立学堂和武备学堂，同时开设馆所编纂新律，开启教育和法律方面的改革。二月初三，广西的游匪杀害了法国兵官，朝廷下令进行剿办，这一事件引发了涉外纠纷，处理起来颇为棘手。二月初六，举行祭祀先师孔子的仪式，彰显对文化教育的重视。二月初七，祭祀大社、大稷，祈求土地五谷丰收。二月十九，刘坤一上书请求因病辞官，朝廷对他进行慰留，刘坤一在当时是朝廷的重要大臣，其去留备受关注。
三月初一，关于交收东三省的条约签订完成，这一事件关系到国家领土主权，引发各方关注。三月初四，皇帝在乾清宫接见意大利公使嘎釐纳，进行外交会见。三月初五，皇帝祭祀先农，并亲自参与耕耤田仪式，以表示对农业的重视。三月初六，皇帝侍奉皇太后前往东陵谒陵，为减轻百姓负担，免除车驾所过州县十分之三的额赋。三月初九至初十，皇帝和皇太后谒拜各座皇陵。三月十五，皇帝驾临南苑，驻跸团河行宫。三月二十三，皇帝一行从东陵返回。三月二十四，皇后举行祭祀先蚕的仪式，体现对蚕桑生产的重视。
这个春天，朝廷免除了宣威、昆明以及齐齐哈尔、墨尔根等地旗屯因灾应赈的物资；同时，免除榆林等地拖欠的赋税，以及西安等厅县十分之二的秋粮，缓解百姓的经济压力。
夏四月初一，皇帝在乾清宫接见俄国公使雷萨尔，进行外交沟通。四月初三，举行常雩祀天仪式，祈求降雨。四月初五，朝廷任命沈家本、伍廷芳参与修订现行法律，推进法律制度的改革。四月初七，李经羲因上奏陈词不当，被免去云南巡抚一职，并交由相关部门议处。四月十一，朝廷任命许鎯为出使意大利大臣，吴德章为出使奥国大臣，杨兆鋆为出使比利时大臣，加强与欧洲各国的外交联系。四月十二，皇后亲自前往桑园采桑，象征着对蚕桑业的倡导。四月十三，朝廷裁撤银库、缎匹库、颜料库，并取消管库大臣一职，对财政和物资管理进行调整。四月二十四，免除滦平受灾地区的地课，帮助当地百姓渡过难关。
五月初二，袁世凯被授予直隶总督兼北洋大臣一职，他在当时的政治舞台上地位愈发重要。朝廷免除双城拖欠的赋税，减轻百姓负担。五月初四，皇帝在乐寿堂接见各国公使，进行外交交流。五月初六，广西的匪患严重，攻陷广南的皈朝，云南官军奋力反击，击退匪军，收复城池，维护地方稳定。五月十六，夏至时节，皇帝前往方泽祭祀地神。五月十八，皇帝在乾清宫接见美国公使康格，继续开展外交活动。
六月初一，朝廷免除鹤庆、宾川受灾地区的杂赋，缓解当地百姓的经济压力。六月初八，朝廷任命孙宝琦为出使法国大臣，胡惟德为出使俄国大臣，梁诚为出使美国、日本、秘鲁大臣，进一步完善外交布局。六月二十二，皇帝在乾清宫接见美国公使康格及博览会会长巴礼德，进行外交会见。六月二十三，朝廷任命张之洞为督办商务大臣，期望他能推动商务发展。六月二十五，朝廷赈济四川南充、简阳等受灾地区，帮助百姓渡过难关。
秋七月十二，朝廷颁布学堂章程，为新式教育的发展提供规范和指导，这是教育改革的重要举措。
八月二十六，朝廷将云南迤西道的驻地迁移到腾越，并让其兼任监督关务一职，加强对地方关务的管理。九月初十，袁世凯奏请裁撤陋规，增加官员公费，并建议其他省份效仿，这一举措旨在整顿官场风气，提高官员待遇。九月十六，黄河在利津、寿张等地决口，给当地百姓带来巨大灾难。九月二十二，皇帝在仁寿殿接见德国公使葛尔士，进行外交沟通。九月二十三，黄河又在惠民决口，水患形势严峻。
九月初六，两江总督刘坤一去世，朝廷追封他为一等男，赠太傅，以表彰其功绩。随后，朝廷任命张之洞暂署两江总督兼南洋大臣，填补重要职位空缺。朝廷免除天津遭受兵灾地区新旧额赋，减轻百姓负担。九月初十，皇帝在仁寿殿接见法国公使贾斯那，开展外交活动。九月十七，皇帝在仁寿殿接见各国公使，进行外交交流。九月二十五，朝廷任命袁世凯为督办商务大臣，伍廷芳为副大臣，让他们负责与各国商议商约，试图在商务领域争取有利条件。
这个秋天，朝廷从国库拨出三十万两白银，后续又拨出义赈款十二万两，并在四川储备物资以备赈灾。同时，还对山东、广东、云南、福建、贵州等地的水灾进行赈济，全力应对自然灾害，保障百姓生活。
冬十月初一，中英商约签订完成，这一商约对两国的经济贸易关系产生重要影响。十月初二，湖南都司刘长儒因未能保护好教士，被处斩，这一事件反映出当时复杂的涉外关系以及清政府在处理此类问题时的无奈。这个月，朝廷赈济山西、陕西受灾地区。云南剑川、鹤庆州，新疆疏勒等厅县发生地震，给当地带来灾难。
十一月初一，朝廷下诏规定，从明年会试开始，凡是被授予编修、检讨以及改任庶吉士和被任用为部属中书的人，都要在京师大学堂学习，获得文凭后，才允许散馆和奏请留任。分省知县也都要进入课吏馆学习，这一举措旨在提高官员素质，推动教育与官员选拔相结合。十一月初二，朝廷任命有泰为驻藏大臣，负责处理西藏地区的事务。十一月初四，朝廷从内库和户部库银中各拨出五万两，送往山东以备赈灾，缓解山东受灾地区的困境。十一月初五，朝廷调魏光焘为两江总督兼南洋大臣，完成重要人事调整。十一月初九，朝廷免除临潼遭受水灾地区五年的地课，帮助当地百姓恢复生产生活。十一月二十三，冬至时节，皇帝前往圜丘祭祀上天。这个月，皇帝在乾清宫接见法国公使吕班、美国公使康格，进行外交活动。
十二月十六，朝廷任命袁世凯为督办电务大臣，负责推进电报事业的发展。十二月二十四，朝廷表彰在异国他乡为父守孝的出使俄国大臣杨儒之子杨锡宸的孝行。这个月，朝廷免除江苏、浙江各厅州县卫的额赋，以及宜良遭受水灾地区的租粮，减轻百姓负担。
光绪二十九年（1903年）正月初一，因局势及筹备来年皇太后七旬圣寿，停止新春筵宴活动。朝廷下诏，为庆贺皇太后寿辰开设庆榜，将本年定为癸卯恩科乡试，来年为甲辰恩科会试，原本的正科乡、会试则顺延至下一届举行。这一安排既体现对皇太后寿辰的重视，也调整了科举时间以适应局势。正月初九，皇帝在乾清宫接见美国公使康格等人，开展外交交流。正月十一，朝廷命荣庆共同管理大学堂事务，旨在加强对新式教育机构的领导。正月十三，皇帝于养性殿接见各国公使，维持外交沟通。正月二十，朝廷免除镇西、疏附受灾地区的粮赋，减轻百姓负担。
二月二十六，惠民县此前决口的黄河河道成功合拢，缓解了水患威胁。
三月初一，发生日食现象。三月初五，皇帝在乾清宫接见德国亲王亨利及公使葛尔士等人。鉴于皇帝谒陵将取道铁路，朝廷下诏禁止地方摊派差徭，且扈从人员的供给也一并免除，意在减轻地方百姓负担。三月初六，朝廷裁撤官学的满、汉总裁及教习职位，对教育机构进行调整。三月初八，皇帝祭祀先农，并亲耕耤田，彰显对农业的重视。随后，皇帝侍奉皇太后前往西陵谒陵。三月初十，皇帝驾临保定府并驻跸，为减轻百姓负担，免除车驾所经州县十分之三的额赋。三月十四，荣禄去世，朝廷追赠其太傅，晋封一等男。同时，朝廷宣布废除印花税及一切苛细杂捐，并规定对借科派之名侵吞财物的行为依法论处。三月十五，命奕劻担任军机大臣，以稳定中枢政务。三月十八，皇帝驾幸南苑；三月二十，驻跸团河。三月二十六，朝廷命奕劻、瞿鸿禨会同户部整理财政，于京师设立银钱铸造总厂；同时，命载振、袁世凯、伍廷芳参与修订商律，推进经济领域改革。三月二十七，皇帝自南苑返回。当月，朝廷免除陕西拖欠的庚子年赋税。
夏季四月十四，皇帝在仁寿殿接见各国公使。四月二十四，云南匪患严重，匪军攻陷临安府城，局势危急。四月二十五，朝廷免除皇帝车驾所经州县的旗租，缓解百姓压力。四月二十六，朝廷任命崇礼为东阁大学士，敬信为协办大学士，调整中枢官员架构。
五月初八，朝廷命铁良会同袁世凯训练京旗兵，以增强京师军事力量。五月十三，户部发生火灾，给财政事务带来影响。五月十九，朝廷任命杨枢为出使日本大臣，负责对日外交事务。五月二十，云南倮夷之乱被平定。五月二十七，朝廷赐王寿彭等三百一十五人进士及第或出身，完成科举选拔。
闰五月初一，朝廷命冯子材会同岑春煊办理广西军务，以应对当地严峻的匪患局势。闰五月初三，朝廷命张之洞会同张百熙、荣庆厘定大学堂章程，完善新式教育制度。闰五月初七，滇军成功收复临安府城，匪首周云祥被诛杀。闰五月初九，自四月以来久旱无雨，直至当日终于降雨，缓解了旱情。闰五月十三，广西巡抚王之春、提督苏元春被革职，朝廷任命柯逢时为广西巡抚，刘光才为广西提督，对广西军政进行人事调整。闰五月十六，皇帝在保和殿亲自主持经济特科人员的御试，选拔特殊人才。闰五月十九，朝廷命马玉昆巡查缉捕近畿地区的盗贼，维护治安。闰五月二十一，中英续订商约达成，这一商约对两国经贸关系产生重要影响。
六月初十，朝廷对考取经济特科的袁嘉谷等人给予不同程度的升迁，以鼓励人才选拔。六月十一，朝廷将苏元春逮捕入狱，进一步处理广西相关事务。六月十五，世铎等人奏请为皇太后加上徽号，皇太后以广西战事紧张、民生困苦为由拒绝，体现出对时局的考量。六月二十五，黄河在利津决口，引发水患。当月，皇帝在仁寿殿接见日本公使内田康哉等人、意大利公使嘎釐纳，开展外交活动；同时，山东烟台发生水灾，朝廷进行赈济，以缓解灾情。
秋季七月初二，朝廷将厦门、鼓浪屿开辟为各国公地，这一举措深刻影响了当地的主权与发展。七月初八，朝廷赏赐郑孝胥四品京堂，命其督办广西边防，并赋予专奏权，加强广西边防事务管理。昆冈退休，离开官场。七月十五，朝廷首次设立商部，任命载振为尚书，旨在推动商业发展，适应近代化需求。
八月初一，王公百官提前请求在来年皇太后七旬万寿时，以报效廉俸的方式表达祝福，皇太后下旨制止，展现其对时局的清醒认识。八月初二，朝廷免除灵州濒临黄河地区的地粮，减轻百姓负担。八月十六，中日商约达成，影响两国经济往来。八月十七，皇帝在仁寿殿接见各国公使，保持外交沟通。八月二十一，朝廷任命敬信为体仁阁大学士，裕德为协办大学士，继续调整官员体系。八月二十六，皇帝在仁寿殿接见法国公使吕班、德国公使穆默，开展外交活动。
九月初十，朝廷命荣庆在军机大臣上学习行走，逐步培养其政务能力。调任那桐为外务部尚书兼会办大臣，加强外交事务管理。九月十一，朝廷命那桐与奕劻、瞿鸿禨共同整理户部财政，荣庆充任政务处大臣，进一步推进财政改革与政务处理。九月十二，朝廷命孙家鼐、张百熙一并充任政务处大臣，完善政务决策体系。
这个秋天，多地遭受自然灾害，朝廷积极开展赈灾工作，对湖北、陕西等地的水灾，怀柔的雹灾，云南各地的水旱灾、雹灾，以及镇西、绥来的蝗灾、冻灾进行赈济，尽力保障受灾百姓生活。
十月初一，皇帝在乾清宫接见荷兰公使希特斯，开展外交交流。十月初八，因英秀在接收阿勒台借地时，提议展缓相关事宜，朝廷命瑞洵前往调查处理。十月十六，朝廷设立练兵处，任命奕劻为总理，袁世凯、铁良为副总理，推进军事改革。十月二十四，朝廷任命岑春煊统领广西诸军，全力解决广西匪患问题。十月二十五，朝廷赏赐杨晟四品卿衔，任命其为出使奥国大臣，拓展外交关系。十月二十六，袁世凯弹劾张翼擅自将开平煤矿及秦王岛口岸售予外国人，朝廷下诏革除张翼职务，并责令其收回相关权益。十一月二十五，朝廷发布谕旨，强调兴学育才的重要性，决定从丙午科开始，逐步递减乡试、会试的中额及各省学额。待各省学堂兴办有成效后，停止科举学额，将人才选拔均纳入学堂考试体系，这是教育制度的重大变革。十一月二十六，朝廷将管学大臣改为学务大臣，任命孙家鼐担任，进一步明确教育管理职责。
十二月初七，广西匪首覃志发等人被诛杀，一定程度上缓解了广西匪患。十二月初九，朝廷下诏，要求内务府再次削减宫廷用费，停止一切非紧急的工程建设，以节省开支。十二月二十，朝廷设置翰林学士撰文一职，并增加员额、更改品级，对翰林制度进行调整。十二月二十七，因日俄两国发生战争，中国宣布遵守局外中立的原则，并向臣民宣谕相关规定，试图在列强冲突中维护自身利益。十二月三十，朝廷授予荣庆军机大臣一职。当月，朝廷免除安州遭受水涝、昆明遭受旱灾地区的田亩租粮，减轻百姓负担。
这一年冬天，朝廷继续开展赈灾工作，对甘肃、云南各州县的水灾，南州、新化的蛟灾，泸州的火灾进行赈济，尽力帮助受灾地区恢复生产生活。
光绪三十年（1904年）正月初一，清政府将广西盐道衙门迁至梧州，同时兼任关监督，意图加强对当地盐务和关税的管理。就在这一天，黄河在利津王庄决口，给沿岸百姓带来严重灾难。正月初二，光绪皇帝在乾清宫接见美、英、法、德、日、意、比、荷、葡等国的公使康格等人，进行外交交流。正月初七，云南提督张春发因犯有罪责，被革职并流放至军台。正月十二，正值皇太后七十岁寿辰，光绪皇帝亲临太和殿，向天下颁布诏书，对各类人员进行不同程度的施恩奖赏。正月十七，云南普洱镇总兵高德元因玩忽职守、祸害百姓，被判处斩首。正月二十七日，朝廷下诏暂停本年秋季的死刑执行，或许是出于特殊时期稳定人心的考虑。
二月初一，出现日食现象。二月初十，光绪皇帝在乾清宫接见葡萄牙公使白朗谷。二月十七，利津的黄河决口成功合拢，在一定程度上缓解了水患危机。
三月初一，光绪皇帝在乾清宫接见德国公使穆默等人。三月初四，御史蒋式瑆因上疏弹劾奕劻但言语缺乏事实依据，被责令回到本官任上。三月初九，王照被投入监狱。三月十一，朝廷免除榆林等州县拖欠的赋税。三月二十八，张德彝与英国签订保工条约，这一举措与当时的劳务输出等事务相关。
夏季四月初二，光绪皇帝在乾清宫接见德国亲王阿拉拜尔、公使穆默。四月二十六，苏元春被流放至新疆。这个月，朝廷还免除了邓川去年受灾应缴纳的粮食，以及新化因遭受蛟灾、呼兰和绥化等地因兵祸拖欠的赋税，以减轻这些地区百姓的负担。
五月初二，朝廷任命道员袁大化负责办理安徽的矿务，期望推动当地矿业发展。五月初六，热河行宫发生火灾，行宫建筑和相关财物遭受损失。五月初七，皇太后下懿旨，特赦戊戌年间的党籍人员，但康有为、梁启超、孙文除外。被革职的人员恢复原衔，被通缉、监禁、编管的人员也予以释放。五月二十，广西叛变的勇丁攻陷柳城，统领祖绳武因作战不力，在军前被斩首。五月二十一，朝廷表彰邢台贡生范凤仪九世同堂的事迹，弘扬传统美德。五月二十五，朝廷赐刘春霖等二百七十三人进士及第或出身，完成科举选拔。五月二十七，皇太后下懿旨，鉴于时局艰难，本年七旬寿节停止举行筵宴，同时禁止将军、督抚等官员来京祝寿，并且免除他们的进献。此外，还裁撤了粤海、淮安关监督以及江宁织造等职务，旨在精简机构、节省开支。
六月初一，朝廷发布谕旨，指出当前时势艰难、百姓困苦，而官吏却蒙蔽实情，导致下情无法上达。尤其州县在钱粮征收方面存在诸多弊端，如浮收中饱、以完作欠等。朝廷要求各督抚迅速将粮额、实际征收数额、正耗收米或折色情况等详细列出简明表册，此外若有其他规费，也需一一登记说明，如实奏报，不得掩饰遗漏，以整顿钱粮征收秩序。六月初四，朝廷任命铁良前往江南考察制造局厂，筹划适宜的发展方案，同时调查其收支款项，以及各司库局所存在的利弊，以加强对工业制造和财政收支的管理。六月初十，朝廷催促岑春煊前往桂、柳地区督师，全力平定广西的叛乱。六月十五，青海住牧盟长车琳端多布等人请求借着年班的机会携带贡物赴京为皇太后祝寿，皇太后下懿旨嘉奖他们的心意，但仍婉言拒绝了贡物，展现出对时局的考量。六月二十五，永定河发生决口。六月二十八，黄河在利津薄庄再次决口，水患形势愈发严峻。
秋季七月初一，光绪皇帝在乾清宫接见比利时公使葛飞业。朝廷裁撤福建水师提督一职，将其归并到陆路提督，同时将陆路提督驻地迁至厦门，对福建地区的军事布局进行调整。七月初七，永定河北下汛再次决口。七月十一，朝廷从内库拨出十万两白银赈济四川的水旱灾，缓解当地灾情。七月十五，英国军队进入西藏境内，达赖喇嘛出逃，朝廷革除达赖的名号，命令班禅额尔德尼代理其事务。七月十七，甘肃黄河决口，皋兰地区受灾，朝廷命令崧蕃负责赈济工作。七月十八，朝廷停止九江进贡瓷器，以减少不必要的开支。七月十九，朝廷任命李兴锐暂署两江总督兼南洋大臣，负责两江地区的政务和外交事务。这个月，朝廷赏赐汤寿潜四品卿衔，命他督办浙江铁路，推动地方交通建设。
八月初一，朝廷裁撤合并内务府的司员，精简宫廷机构人员。八月十七，朝廷赏赐唐绍仪副都统衔，派他前往西藏查办相关事件，以应对英国入侵西藏带来的复杂局面。八月二十五，光绪皇帝在仁寿殿接见意大利公使嘎尼纳。八月二十七，光绪皇帝在乾清宫接见墨西哥公使郦华，持续开展外交活动。
九月初一，光绪皇帝在乾清宫接见英国公使萨道义。九月初八，敬信因患病被免职。九月二十四，李兴锐去世，朝廷任命周馥暂署两江总督兼南洋大臣。由于英国军队进入西藏，达赖喇嘛求救，朝廷命令德麟进行安抚。不久后，英国军队撤退，朝廷又敕令唐绍仪为议约全权大臣，负责与英国就西藏问题进行谈判。九月二十八，朝廷将湖北粮道改为施鹤兵备道，对地方官职进行调整。
这个秋天，朝廷免除了吉林因兵祸、云南因水旱和兵灾拖欠的赋税，以及武威、金州的部分额赋，以减轻受灾地区百姓的经济负担。同时，朝廷对云南、顺天、福建、甘肃、江西等地的水灾，以及山西、浙江、广东等地的其他灾害进行赈济，尽力帮助受灾民众渡过难关。
冬季十月初一，吕海寰续订中葡商约达成，这对中葡之间的贸易关系产生重要影响。朝廷任命裕德为体仁阁大学士，世续为协办大学士，调整中枢官员架构。十月初五，光绪皇帝在皇极殿接见奥、美、德、俄、比等国的公使齐幹等人。永定河的决口成功合拢，水患治理取得阶段性成果。十月初七，光绪皇帝侍奉皇太后驾临仁寿殿，赐宴给近支宗藩等人，王、贝勒、贝子、公等还在宴会上进舞，展现皇家的团聚与庆祝氛围。十月初九，皇太后寿辰，光绪皇帝前往排云殿进表祝贺。十月十六，光绪皇帝在皇极殿接见英、日、法、韩等国的公使萨道义等人。十月二十一，皇太后下懿旨，禁止各省借着推行新政的名义巧立名目，征收苛细私捐。对于一切与百姓教养相关的学堂、工艺等事务，官府应进行劝导，由绅民自行筹集资金，不得滋生苛扰。此外，还废除了浙江堕民的户籍限制，允许他们进入学堂学习，毕业者给予相应的出身，这是在社会阶层方面的一次重要变革。
十一月初一，朝廷任命荫昌继续担任出使德国大臣，曾广铨担任出使韩国大臣，负责相关外交事务。四川打箭炉发生地震，给当地带来灾害。十一月初三，光绪皇帝在乾清宫接见意大利公使巴乐礼。十一月初八，广西匪首陆亚发被诛杀，一定程度上缓解了广西的匪患问题。十一月十四，朝廷确定新的军官制度，推进军事改革。十一月三十，朝廷谕令增祺赈抚东三省的难民，保障难民的基本生活。
十二月初五，光绪皇帝在皇极殿接见意大利公使巴乐礼、荷兰公使希特斯、葡萄牙公使阿梅达等人。十二月十一，朝廷裁撤江安粮道，将江南盐道改为盐粮道，对地方粮盐管理机构进行调整。十二月十四，朝廷从内库拨出三十万两白银赈济奉天的难民。十二月十九，直隶地区开始推行公债票，以筹集资金。十二月二十三，朝廷裁撤漕运总督一职，设置江淮巡抚，对漕运和地方行政进行重大调整。十二月二十四，朝廷设立贵胄学堂，旨在培养皇家贵族子弟。十二月二十五，朝廷设置黑龙江巡道并兼任按察使衔，以及兰绥海兵备道，还有呼兰、绥化二府，加强对黑龙江地区的管理。十二月二十八，朝廷下令修建四川都江堰，改善当地水利设施。
这一年冬天，朝廷还裁撤了湖北、云南巡抚以及湖南、陕西粮道等职务，进一步精简机构。同时，免除了石屏、赵州的秋粮，陈留等州县拖欠的赋税，以及朝邑遭受水灾地区的部分额赋，以减轻百姓负担，稳定社会秩序。
光绪三十一年（1905年）正月初一，光绪皇帝在乾清宫接见德、英、日、法等十三个国家的公使，展现外交活动的频繁。同日，达赖喇嘛请求在库伦建庙诵经，朝廷以不合规矩等缘由未予批准，并命其仍回西藏，妥善安抚民众。正月十七，铁良奏报考察各省营伍情况，称湖北陆军表现最为优异，光绪帝下诏予以嘉奖，同时对江南各军统领进行了不同程度的奖惩。同日，任命唐绍仪为出使英国大臣，负责对英外交事务。
二月初一，皇太后下懿旨，从内库拨出三十万两白银抚恤东三省难民，缓解当地民众的苦难。二月初六，命长庚、徐世昌对改编的三镇新军进行考验，加强军事管理与训练。二月二十二，景陵隆恩殿发生火灾，这一皇家陵寝建筑的损毁引发重视。二月二十六，光绪皇帝在海晏堂接见美国公使康格。二月二十八，对阿拉善游牧地区进行赈济，保障当地百姓生活。二月二十九，免除陕西前年拖欠的粮食赋税，减轻百姓负担。
三月初二，奉天发生饥荒，局势严峻；俄国军队进入长春并占据此地，严重侵犯中国主权。三月初三，巴塘番人焚毁法国教堂，驻藏帮办凤全前往剿捕时遭遇埋伏身亡，朝廷随即饬令四川提督马维骐前往进剿，并命柯逢时负责管理八省土膏统捐事宜，以筹集资金。三月初四，光绪皇帝在乾清宫接见德国亲王福礼留伯和公使穆默。三月初六，下诏要求各督抚举荐能够胜任提督、总兵官职的人才。三月十六，云南省城开辟为商埠，试图通过通商促进经济发展。三月十七，废除新设置的江淮巡抚一职，将淮扬总兵改为江北提督，调整地方行政与军事架构。三月二十，谕令更改制定法律，规定死罪最重仅到斩决为止，废除凌迟、枭首、戮尸等酷刑，斩、绞、监候等刑罚依次递减，缘坐各条除知情者外其余全部宽免，同时废除刺字等条例。三月二十一，鉴于禁止刑讯，对笞、杖刑罚进行变通，要求清查监狱和羁留场所，谕令各督抚切实执行。三月二十二，犍为匪徒发动叛乱，被官军迅速剿平。三月二十三，命周馥前往江北筹划吏治、海防、河工、捕务等事务，加强对江北地区的管理。
四月初一，因俄国军舰抵达南洋，朝廷谕令相关地区做好预防，并禁止商人向其运送煤炭。同时更改制定窃盗条款，将应拟笞、杖刑罚者改为罚做工作。四月初二，谕令各省府州县设立罪犯习艺所，旨在改造罪犯。四月初三，赏刘永庆侍郎衔，命其署理江北提督，赋予其节制镇、道以下官员的权力。四月初四，裁撤广东粮道，设置廉钦兵备道，调整地方官职。四月初六，命程德全署理黑龙江将军，负责当地军政事务。四月初九，德国兵舰突然抵达海州进行测量，朝廷饬令严加责问，维护领土主权。
五月十四，光绪皇帝在乾清宫接见日本公使贾思理、美国公使柔克义。五月二十，在皇极殿接见墨西哥公使胡尔达。五月二十七，王文韶被免去军机大臣职务，命徐世昌在军机大臣上学习行走，兼任政务处大臣；同时，铁良、徐世昌共同负责练兵事务，调整中枢权力与军事管理架构。
六月初三，光绪皇帝在仁寿殿接见俄国公使璞科第。免除中牟等州县拖欠的赋税。六月十一，给予考试合格的留学生金邦平等人进士、举人出身。命载泽、戴鸿慈、徐世昌、端方前往东西洋各国考察政治，寻求变革之道。六月十五，下诏设置盛京三陵守护大臣，裁撤盛京户、礼、兵、刑、工五部侍郎，对盛京地区官职进行调整。六月十六，任命世续为体仁阁大学士，那桐为协办大学士。六月二十，裁撤广东巡抚一职，精简行政机构。六月二十七，贵州匪徒攻陷都匀的四寨，后被官军收复。
七月初三，废除御史巡视五城及街道厅制度，将练勇改编为巡捕，改革地方治安管理模式。七月十二，续派绍英为出洋考察政治大臣，加强考察队伍。七月十六，鉴于巴塘战事，开放实官捐纳一年，以筹集军费等资金。七月二十三，赏廷杰侍郎衔，命其前往奉天办理垦荒事务。常德、湘潭开辟为商埠。七月二十四，命铁良在军机大臣上学习行走，不久后兼任政务处大臣，进一步充实中枢力量。
八月初一，朝廷发布谕令，指出各省工商抵制美约的行为既妨碍邦交，又损害商务，要求各地疆吏进行劝诫引导，并及时稽查。八月初三，下诏废除科举制度，这是中国教育史上的重大变革，对人才选拔和社会发展产生深远影响。八月初五，裁撤奉天府尹、府丞，改设东三省学政，调整教育管理机构。命刘式训为出使法日大臣，黄诰为出使义国大臣，周荣曜为出使比国大臣，后因周荣曜问题改任李盛铎。八月初六，免除奉天北路遭受兵灾地区的额赋。八月初十，从内库拨出三万两白银，用于江苏的应急赈灾。八月十二，下诏规定各省学政专门负责考核学堂事务，此后学政事宜归学务大臣考核。八月十七，新疆巡抚潘效苏因侵吞款项被革职，流放至军台。八月十八，命袁世凯、铁良校阅新军秋操，加强军事训练与检阅。八月二十一，命汪大燮为出使英国大臣，杨晟为出使德国大臣，李经迈为出使奥国大臣。八月二十三，开辟海州为商埠。八月二十四，改命李经方为商约大臣。八月二十六，载泽等人启程出洋考察政治，刚登上火车，就有人投掷炸弹，朝廷得知后下诏严厉追捕并从重惩处相关人员。八月二十八，巴塘叛乱被平定，匪首喇嘛阿泽、隆本郎吉等人被诛杀。
九月初五，因三品京堂周荣曜曾充任关书，侵吞巨额公款，朝廷将其革职逮捕治罪，并没收其财产。九月初九，首次设置巡警部，任命徐世昌为尚书，推进近代警察制度建设。九月十九，北新仓发生火灾，影响粮食存储与供应。九月二十，论及肃清广西的功绩，晋升岑春煊为太子少保衔，对李经羲予以优厚奖励。九月二十五，光绪皇帝在勤政殿接见德国公使穆默。九月二十七，命尚其亨、李盛铎会同载泽等人前往各国考察政治，扩大考察团队。
这年秋天，朝廷对贵州、云南等地的水灾，太康的风灾，镇番及巴燕戎格的雹灾和风灾进行赈济，尽力帮助受灾民众渡过难关。
十月初一，光绪皇帝在勤政殿接见日本公使内田康哉等人。设置吉林哈尔滨道，加强对当地的管理。十月十四，芦汉铁路建成通车，这是重要的交通基础设施建设成果。英国军队入侵西藏后，索赔款一百二十余万两，朝廷谕令由国家代为支付，以体恤西藏民众的艰难处境。十月二十，制定铸造银币及行用章程，规范货币制度。十月二十三，任命陆徵祥为出使荷国大臣，兼理海牙和平会事务。十月二十六，设置考察政治馆，选取各国适合中国治理体系的政法制度，进行斟酌损益，编纂成书后请旨裁定。同时下诏指出，近期有不法之徒宣扬革命排满言论，假借党派名义暗中进行叛逆活动，要求各地疆臣严厉禁止并秘密缉拿，对首从各犯按照谋逆罪论处，以维护统治秩序。
十一月初一，陕、洛地区的会匪被平定。十一月初二，裕德去世。十一月初七，废除驻韩使臣，改设总领事，调整外交机构设置。十一月初十，下诏设置学部，将国子监归并其中，调任荣庆为尚书，推动教育管理的近代化。十一月二十六，中日签订新约。
十二月初七，授予那桐体仁阁大学士，荣庆为协办大学士。十二月十九，设置京师内外城巡警总厅，撤销工巡局，进一步完善京师治安管理体系。任命徐世昌、铁良为军机大臣，巩固中枢决策力量。当月，免除盛京各旗、陕西各属遭受兵灾地区拖欠的赋税，以及安州因长期积水、韩城因水灾冲毁土地应缴纳的地租。
这年冬天，朝廷对会泽的潦灾，荆州的水灾，英吉沙尔的水灾和雹灾进行赈济，缓解灾情带来的影响。
光绪三十二年（1906年），清政府在国内外复杂局势的冲击下，为寻求变革与稳定，于外交、教育、政治等多领域积极施策，同时应对自然灾害与社会动荡，在艰难探索中试图维系统治根基。
正月初三，朝廷宣布暂缓布特哈进贡貂皮，一定程度上减轻当地民众负担。正月初四，光绪皇帝在乾清宫接见德、英、法等十二国公使穆默等人，维持外交沟通。正月十四，漳浦匪首张婴被官府诛杀，地方治安得到一定恢复。正月十九，徐郙因考核政绩未达标被罢官。正月二十一，朝廷任命瞿鸿禨为协办大学士，调整中枢官员架构。
二月，朝廷下诏要求各省保护教堂及外国人的人身和财产安全，以缓和中外矛盾。当月，光绪皇帝在勤政殿接见德国公使穆默等人；同时，清政府拿出十万两库银，援助日本赈灾，展现外交互动与国际援助。
三月初一，朝廷以“忠君、尊孔、尚公、尚武、尚实”五大纲领作为教育宗旨，并向全国宣告，旨在规范教育方向。三月初三，朝廷废除八旗秀女选拔制度，这是满族宫廷制度的一项变革。三月初九，朝廷派遣汪大燮前往日本祝贺天皇婚礼，加强两国友好往来。三月十九，江苏通州开辟为商埠，试图通过通商促进经济发展。三月三十，美国旧金山发生地震，清政府拨付十万两库银赈济当地华民，体现对海外侨民的关怀。当月，奥匈帝国公使顾新斯基、意大利公使巴乐礼、德国公使穆默、法国公使吕班等先后受到皇帝接见，外交活动频繁。
这年春天，朝廷免除浙江仁和等盐场及各州县，杭、严、衢三所的灶课，还有荒地山塘杂课；同时，免除云南、湖南、新疆受灾地区的粮食赋税，以及陕西拖欠的赋税，减轻多地百姓经济压力。
夏四月初一，朝廷派遣陆徵祥前往瑞士商议红十字会公约相关事宜，推动国际事务合作。四月初二，朝廷裁撤各省学政，改设提学使，改革地方教育管理体制。四月初三，光绪皇帝在勤政殿接见日本公使内田康哉。四月十六，朝廷任命铁良为督办税务大臣，唐绍仪为副大臣，加强税务管理。四月二十，朝廷从湖南库银中拨出十万两赈济当地水灾。
闰四月十四，因天气异常，灾害频发，皇太后下懿旨告诫君臣上下要相互警醒，共同应对危机。闰四月十六，唐炯因年老体衰，被解除云南矿务职务。
五月初一，朝廷从国库拨出五万两白银赈济广东水涝灾害。五月初六，河南沁河河水泛滥，朝廷及时开展灾民赈济工作。当月，光绪皇帝在乾清宫接见法国公使巴思德、意大利亲王费尔迪安德等人，持续推进外交交流。
六月初一，德国减少在直隶的驻军，并归还廊坊、杨村、北戴河、秦王岛、山海关等地，一定程度上缓解了地区紧张局势。六月十四，沅陵匪首覃加位被诛杀，维护地方治安。
这个夏天，朝廷免除浪穹过去拖欠的赋税、莎车因灾荒废土地的额赋，以及甘肃、云南受灾地区拖欠的赋税；同时，赈济武陟水灾、朝阳火灾，尽力救助受灾民众。
秋七月初一，朝廷设置川滇边务大臣，任命赵尔丰担任此职，并赏赐侍郎衔，加强对川滇边境地区的管理与开发。同日，沁河决口成功合拢。七月初三，江苏将水陆各营旗防军改编为巡防队，进行军事制度调整。七月初四，出国考察政治的大臣载泽等人返回京城，并呈上密奏。朝廷命醇亲王、军机政务处大臣、大学士、北洋大臣共同审阅，以决定是否采纳。七月初八，奉天的大东沟开辟为商埠，并设立海关，由东边道兼任海关监督，促进对外贸易。七月十一，朝廷发布谕旨称，载泽等人奏陈国家衰弱源于上下隔阂，而各国富强在于实行宪法、听从公论，因此决定仿行宪政，将大权统归朝廷，同时让民众参与部分政务讨论，着手预备立宪基础，要求内外臣工切实振兴。次日，朝廷再次谕令，预备立宪需先厘定官制，命大臣编纂相关方案，由奕劻、孙家鼐、瞿鸿禨总负责核定，最后请旨施行。同时，调任端方为两江总督兼南洋大臣。七月二十六，朝廷从江苏库银中拨出十万两赈济徐、海、淮西等地的水灾。
八月十九，朝廷免除临川被水冲毁土地的额赋。八月二十二，光绪皇帝在仁寿殿接见日本王爵博恭、公使林权助。当月，朝廷赈济安徽水灾、广东风灾、湖州涝灾，积极应对多地自然灾害。
九月初六，光绪皇帝在仁寿殿接见各国公使。九月初九，朝廷赐予游学毕业的陈锦涛等人各科进士、举人出身，鼓励留学教育。九月十七，朝廷下诏更改官制，内阁、军机处、外务部等部分机构保持不变；将巡警部改为民政部，户部改为度支部，兵部改为陆军部，刑部改为法部，工部与商部合并为农工商部，理藩院改为理藩部，各部门设尚书一人、侍郎二人，且不分满汉；都察院设都御史一人、副都御史二人；将六科给事中改为给事中，大理寺改为大理院；增设邮传部、海军部、军谘府、资政院、审计院；将财政处并入度支部，太常寺、光禄寺、鸿胪寺并入礼部，太仆寺、练兵处并入陆军部；各部尚书均兼任参预政务处大臣。同时，任命世续为军机大臣，林绍年在军机大臣上学习行走，鹿传霖、荣庆、徐世昌、铁良不再担任军机大臣，转而专门管理部务。九月十八，朝廷从广东库银中拨出十万两，赈济香港及潮、高、雷、钦、廉等地的风灾。九月二十，朝廷将政务处改为会议政务处。九月二十一，朝廷任命曾广铨以三品京堂身份担任出使德国大臣。
冬十月初七，正值皇太后寿辰，因局势未稳，朝廷取消筵宴庆祝活动。十月十七，光绪皇帝在乾清宫接见英国公使朱迩典、比利时公使柯霓雅。十月十九，朝廷裁撤并合并广东陆路、水路提督，改为广东提督，精简地方军事官职。十月二十一，光绪皇帝在勤政殿接见日本公使林权助。十月二十二，浏阳、醴陵的匪首巫王永求、陈显龙发动叛乱，被官军迅速擒获斩杀。十月二十四，朝廷调拨三十万漕折银，用于赈济江苏地区。十月二十六，朝廷在京师设立官报局，加强舆论宣传与信息传播。
十一月初五，朝廷留下广东应上缴的十万两京饷，用于当地赈灾。十一月初八，朝廷免除广西锑矿的出井税，促进矿业发展。十一月初十，朝廷从陕西官银中拨出八万两，援助江苏赈灾。十一月十四，朝廷下诏将孔子祭祀规格提升为大祀，并命相关部门商议具体典礼细节。十一月十九，朝廷下诏让各省商议币制改革事宜。十一月二十三，朝廷在曲阜修建学堂，并从内库拨出十万两白银资助工程建设。当月，光绪皇帝在勤政殿接见墨西哥公使胡尔达，在乾清宫接见德国公使雷克司、法国公使巴思德、英国公使朱迩典，持续开展外交活动。
十二月初一，出现日食现象。十二月初五，朝廷增加京官的养廉银，试图改善官员待遇。十二月十二，朝廷将驻各国公使的官阶改为二品实官，调整外交官员职级。
这年冬天，朝廷赈济普宁、赵州、罗平、师宗等地的灾害，以及江宁、扬州的水灾；同时，免除滦平、安州因涝灾应缴纳的粮赋，永城的额赋，陕西咸宁等地拖欠的赋税，永平、太和、昆明受灾地区拖欠的粮食，全力减轻受灾地区民众负担。
光绪三十三年（1907年）正月初三，光绪皇帝在乾清宫接见各国公使，维持外交沟通。正月初九，朝廷裁撤各部小京官，开启精简机构的举措，旨在优化行政体系、节省开支。
二月初四，驻藏大臣有泰因在处理西藏事务中存在失误，被革职并流放至军台，这反映出朝廷对边疆事务管理的重视与对失职官员的惩处。二月十二，朝廷截留江苏漕粮十五万石，用于储备救灾物资，以应对可能出现的灾情。
三月初七，光绪皇帝在勤政殿接见日本公使林权助等人，继续开展外交活动。三月初九，长春、哈尔滨被开辟为商埠，这是清政府试图通过开放通商口岸，促进经济发展、加强与外部联系的举措。三月初十，朝廷对东北地区官职进行重大调整，将盛京将军改为东三省总督，裁撤吉林、黑龙江将军，改设奉天、吉林、黑龙江三位巡抚，并任命徐世昌为钦差大臣、东三省总督，以加强对东北地区的管理与开发。三月十三，朝廷任命顺天府尹孙宝琦为出使德国大臣，负责对德外交事务。三月二十三，任命天津道梁敦彦为出使美墨秘古大臣；同日，任命陆徵祥为保和会专使大臣，李经方为出使英国大臣，钱恂为出使荷国大臣，进一步完善外交布局。三月二十八，昆冈去世，中枢官员体系出现变动。
这个春天，朝廷免除中卫遭受水灾以及榆林等地拖欠的赋税，同时免除云南因旱灾等受灾州县拖欠的粮食赋税及额赋，以减轻民众负担、缓解社会矛盾。
四月初五，朝廷裁撤各省民壮捕役，改设巡警，推动地方治安体系向近代化转型。绥来发生地震，给当地带来灾害。四月初六，御史赵启霖因污蔑亲贵被革职，这一事件引发朝堂震动。四月十二，朝廷进一步更定东三省官制，在奉天、吉林、黑龙江分别设立行省公署，以总督为长官、巡抚为次官，并设置左右参赞，分领承宣、谘议两厅，同时分设交涉、旗务等七个职能司，以及提法使、督练处等官职，使东三省行政体系更加规范化、专业化。四月二十，因天气干旱，朝廷举行祈雨仪式。四月二十二，鉴于江北发生水灾，朝廷严格禁止米粮出口，以保障灾区粮食供应、稳定粮价。四月二十八，朝廷确定陆海军官制，陆军部设两厅十司，军谘处五司，海军部六司，推进军事制度的近代化改革。四月二十九，朝廷命衍圣公孔令贻负责稽查山东学务，借助其影响力推动地方教育发展。
五月初五，巴塘等地喇嘛胁迫河西蛮发动叛乱，官军迅速出兵将其平定，维护了地方稳定。五月初七，朝廷任命王士珍以侍郎衔署理江北提督，加强对江北地区的军事管理。五月初八，西陵禁山发生火灾，引发对皇家陵寝安全的关注。五月初九，瞿鸿禨被罢官，中枢权力格局发生变化。五月十一，朝廷任命鹿传霖为军机大臣，同时命醇亲王载沣进入军机处，进一步充实中枢决策力量。五月十三，王文韶被罢官，朝廷任命张之洞为协办大学士，调整高层官员职务。五月十五，崇礼去世。五月二十九，朝廷将按察使改为提法使，设置巡警道、劝业道，裁撤分守、分巡各道，酌情保留兵备道，并分设审判厅，为司法独立做准备，同时增加辅助治理官员，为地方自治创造条件，计划在十五年内全面推行。五月三十，朝廷下诏，称宪法之下官民均有责任，鼓励大家建言献策，提出预备立宪的方法和施行步骤，朝廷将进行甄别采纳。此外，安徽候补道徐锡麟刺杀巡抚恩铭，徐锡麟被捕后被处死，这一事件震惊朝野，凸显社会矛盾的尖锐。
六月初三，朝廷任命李家驹为出使日本大臣，负责对日外交。六月初八，恢复御史赵启霖的官职，这一反复引发诸多议论。六月十四，自四月以来久旱无雨，直至当日才降下雨水，缓解了旱情。朝廷授予张之洞体仁阁大学士，鹿传霖协办大学士，进一步明确官员职衔。六月二十七，朝廷取消皇帝万寿节的筵宴活动。永定河发生决口，引发水患危机。
这个夏天，朝廷免除新化遭受水灾地区的额赋、伊通因贼患拖欠的赋税，以及云南因旱灾等受灾州县的银米赋税；同时，赈济云南饥荒及直隶水灾，全力救助受灾民众、稳定社会秩序。
秋七月初三，朝廷下诏，要求中外臣工商议如何消除满汉之间的隔阂，促进民族融合，这是清政府在民族政策上的一次重要调整。七月初六，朝廷将考查政治馆改为宪政编查馆，规定军机大臣、大学士、参预政务大臣的议事活动在阁内进行，推进宪政筹备工作。七月十四，皇太后下懿旨，派遣杨士琦前往南洋各埠考察，并鼓励华侨回国投资兴业，以促进经济发展。朝廷免除赵州、禄丰受灾地区的额赋，同时赈济顺天等地的灾民，以及浏阳、邵阳的蛟灾。七月十六，朝廷下诏指出，匪徒常以革命为名进行煽动，要求各督抚设法解散相关组织，对抓获的罪犯按叛逆、盗匪等不同罪名论处，避免株连被胁迫者及不知情家属。朝廷任命张荫棠为全权大臣，与英国商议西藏相关条约。敬信去世。七月二十一，朝廷确定限期编练陆军三十六镇，加强军事力量建设。七月二十八，朝廷任命张之洞、袁世凯为军机大臣，同时任命袁世凯为外务部尚书，进一步调整中枢与外交的权力配置。七月二十九，朝廷任命杨士骧署理直隶总督兼北洋大臣，负责重要地区的军政事务。七月三十，李经迈因母亲生病辞去职务，朝廷任命雷补同充任出使奥国大臣。八月初一，黄河在孟县决口，加剧了水患灾害。
八月初三，光绪皇帝身体不适，朝廷下诏要求各省举荐精通医理的人才。朝廷任命汪大燮出使英国，达寿出使日本，于式枚出使德国，均担任考察宪政大臣，进一步推进宪政考察工作。八月初四，朝廷在京师设置高等审判厅，推动司法体系的近代化。八月十一，设置总检察厅，完善司法机构设置。八月二十八，朝廷设立资政院，任命贝子溥伦、孙家鼐为总裁，为立宪政治做制度准备。八月二十九，朝廷任命伍廷芳为出使美国大臣，萨荫图为出使俄国大臣。九月初三，朝廷下诏要求各省驻防人员改变游手好闲的习气，命各将军等分配田地督促耕种，归农后相关事务由地方官府治理，试图解决旗人生计问题。九月初五，朝廷裁撤奉天驿站，设立文报局，改进信息传递方式。九月初七，朝廷下诏要求中外臣工深入研究君主立宪政体，并谕令制定自治章程，加快宪政筹备步伐。九月初十，光绪皇帝在仁寿殿接见德国公使雷克司、日本公使阿部守太郎，同时谕令神机营卫队及官兵归陆军部管辖，加强军事统一管理。
九月二十，朝廷下诏议定满汉礼制、刑律，考定度量权衡统一制度章程，推动制度规范化。同日，因吸食鸦片恶习未改，庄亲王载功、睿亲王魁斌、都御史陆宝忠、副都御史陈名侃被责令解职，要求迅速戒除烟瘾，并谕令内外文武官员在三个月内戒除，否则将严惩，以整顿官场风气、提高官员身体素质。九月二十二，朝廷任命沈家本、俞廉三、英瑞为修订法律大臣，推进法律改革。九月二十八，朝廷命令各省设立谘议局，公开选举议员，并筹备设立州、县议事会，推动地方民主政治发展。十月初一，日本因水灾前来请求购买粮食，清政府从江、皖、浙、鄂等省调拨六十万石米粮予以援助，展现外交互动与国际互助。十月初三，朝廷命令各省设立调查局，各部、院设立统计处，加强信息收集与管理。朝廷赐予游学毕业生章宗元等人进士、举人出身，鼓励留学教育。十月初七，湖北按察使梁鼎芬上书弹劾奕劻、袁世凯等人相互勾结、贪私误国，认为禁止贿赂、杜绝请托是挽回时局的关键，然而朝廷以其有意沽名钓誉，对其进行斥责，这一事件反映出朝廷内部的矛盾与斗争。当月，朝廷免除云南因旱灾受损等州县的税粮，赈济怀宁等县水灾。
冬十月初七，朝廷任命孙家鼐、荣庆等人为经筵讲官，负责为皇帝讲解经史及本朝掌故，以提升皇帝的治国理政能力。永定河决口成功合拢，缓解水患危机。十月初十，正值皇太后寿辰，朝廷取消筵宴活动。十月十四，光绪皇帝在勤政殿接见日本公使林权助等人。十月二十八，哲布尊巴丹胡图克图向朝廷进献地方特产，体现边疆与中央的联系。
十一月初三，广西匪徒占据南关炮台，朝廷责令张鸣岐督率军队进剿，不久后成功收复炮台，维护了边疆安全。十一月二十一，朝廷严格禁止聚众开会演说，以加强社会管控。朝廷谕令各省整顿学堂，增订考核劝诫办法，推动教育发展。十一月二十五，光绪皇帝在乾清宫接见俄国公使璞科第等人。鉴于内外臣工对币制改革中采用两用元存在不同意见，朝廷谕令各督抚结合地方实际情况进行考察商议并奏报。朝廷拨出五十万两库银，接济广西军队，保障军事行动顺利开展。
十二月初一，朝廷重新分设广东陆路提督、水师提督，调整地方军事布局。十二月初六，朝廷裁撤吉林副都统，设置交涉、民政、度支三司使以及提法使、劝业道，完善地方行政体系。朝廷对进士馆游学毕业学员杨兆麟等人给予晋升奖励。十二月十五，朝廷裁撤山东粮道，设置巡警道、劝业道，推动地方治理改革。十二月十七，朝廷谕令热河围场开展屯垦活动，裁撤驻防官兵，优化边疆地区管理。十二月十八，朝廷任命吕海寰为督办津浦铁路大臣，负责重要铁路建设事务。十二月十九，那桐兼任督办税务大臣，加强税务管理。十二月二十四，朝廷赏赐总税务司赫德尚书衔，以表彰其在税务工作中的贡献。十二月二十九，朝廷再次下令暂缓布特哈进贡貂皮一年，减轻地方负担。
这年冬天，朝廷免除云南因旱灾、直隶因水涝以及陕西拖欠的赋税；同时，赈济云南等地的蛟灾、四川水灾、广东风灾水灾，积极应对自然灾害，缓解灾情对民众生活的影响，维持社会稳定。